Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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TrmuQ9DAT5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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TrmuQ9DAT5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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TrmuQ9DAT5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrmuQ9DAT5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms