Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Asf1bQ9DAP7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms