Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Samd8Q9DA37 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms