Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Q6

Calr3, Calreticulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr3Q9D9Q6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calr3Q9D9Q6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calr3Q9D9Q6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calr3Q9D9Q6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calr3Q9D9Q6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calr3Q9D9Q6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calr3Q9D9Q6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calr3Q9D9Q6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calr3Q9D9Q6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calr3Q9D9Q6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calr3Q9D9Q6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calr3Q9D9Q6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calr3Q9D9Q6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calr3Q9D9Q6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calr3Q9D9Q6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calr3Q9D9Q6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calr3Q9D9Q6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calr3Q9D9Q6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calr3Q9D9Q6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calr3Q9D9Q6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calr3Q9D9Q6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calr3Q9D9Q6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calr3Q9D9Q6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calr3Q9D9Q6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calr3Q9D9Q6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calr3Q9D9Q6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calr3Q9D9Q6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calr3Q9D9Q6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calr3Q9D9Q6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calr3Q9D9Q6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Calr3Q9D9Q6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Calr3Q9D9Q6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calr3Q9D9Q6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Calr3Q9D9Q6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calr3Q9D9Q6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calr3Q9D9Q6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calr3Q9D9Q6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calr3Q9D9Q6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms