Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn34b2Q9D9N2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms