Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot8Q9D8X5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot8Q9D8X5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot8Q9D8X5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot8Q9D8X5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot8Q9D8X5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot8Q9D8X5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot8Q9D8X5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot8Q9D8X5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot8Q9D8X5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot8Q9D8X5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot8Q9D8X5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot8Q9D8X5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot8Q9D8X5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot8Q9D8X5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot8Q9D8X5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot8Q9D8X5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot8Q9D8X5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot8Q9D8X5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot8Q9D8X5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot8Q9D8X5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms