Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin37Q9D8N6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms