Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms