Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms