Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7X1

Kctd4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd4Q9D7X1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kctd4Q9D7X1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kctd4Q9D7X1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms