Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp5Q9D7S9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms