Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp4cQ9D7F7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms