Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfsf13Q9D777 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfsf13Q9D777 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfsf13Q9D777 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfsf13Q9D777 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfsf13Q9D777 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfsf13Q9D777 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfsf13Q9D777 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfsf13Q9D777 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfsf13Q9D777 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfsf13Q9D777 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfsf13Q9D777 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfsf13Q9D777 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfsf13Q9D777 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfsf13Q9D777 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfsf13Q9D777 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfsf13Q9D777 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfsf13Q9D777 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfsf13Q9D777 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfsf13Q9D777 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfsf13Q9D777 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfsf13Q9D777 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfsf13Q9D777 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfsf13Q9D777 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfsf13Q9D777 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfsf13Q9D777 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms