Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
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Nop56Q9D6Z1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Nop56Q9D6Z1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Nop56Q9D6Z1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nop56Q9D6Z1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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