Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gbe1Q9D6Y9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gbe1Q9D6Y9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gbe1Q9D6Y9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gbe1Q9D6Y9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gbe1Q9D6Y9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbe1Q9D6Y9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbe1Q9D6Y9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbe1Q9D6Y9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbe1Q9D6Y9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbe1Q9D6Y9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbe1Q9D6Y9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbe1Q9D6Y9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbe1Q9D6Y9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbe1Q9D6Y9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbe1Q9D6Y9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbe1Q9D6Y9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbe1Q9D6Y9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbe1Q9D6Y9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbe1Q9D6Y9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbe1Q9D6Y9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbe1Q9D6Y9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbe1Q9D6Y9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbe1Q9D6Y9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbe1Q9D6Y9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbe1Q9D6Y9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbe1Q9D6Y9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbe1Q9D6Y9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbe1Q9D6Y9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbe1Q9D6Y9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbe1Q9D6Y9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbe1Q9D6Y9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbe1Q9D6Y9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbe1Q9D6Y9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbe1Q9D6Y9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbe1Q9D6Y9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbe1Q9D6Y9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbe1Q9D6Y9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbe1Q9D6Y9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms