Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms