Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PudpQ9D5U5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms