Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Y3

Rhox2a, Reproductive homeobox 2A, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2aQ9D4Y3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox2aQ9D4Y3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox2aQ9D4Y3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox2aQ9D4Y3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox2aQ9D4Y3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox2aQ9D4Y3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox2aQ9D4Y3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox2aQ9D4Y3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms