Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms