Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms