Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam90a1bQ9D4F3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fam90a1bQ9D4F3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fam90a1bQ9D4F3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fam90a1bQ9D4F3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fam90a1bQ9D4F3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fam90a1bQ9D4F3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam90a1bQ9D4F3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam90a1bQ9D4F3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam90a1bQ9D4F3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam90a1bQ9D4F3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam90a1bQ9D4F3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam90a1bQ9D4F3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam90a1bQ9D4F3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam90a1bQ9D4F3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam90a1bQ9D4F3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam90a1bQ9D4F3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam90a1bQ9D4F3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms