Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3F6

Ms4a4c, MCG12897, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4cQ9D3F6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ms4a4cQ9D3F6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ms4a4cQ9D3F6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ms4a4cQ9D3F6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ms4a4cQ9D3F6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ms4a4cQ9D3F6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ms4a4cQ9D3F6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 E130114P18Rik-201ENSMUST00000107067 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms