Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vsig1Q9D2J4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms