Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SarnpQ9D1J3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SarnpQ9D1J3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SarnpQ9D1J3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SarnpQ9D1J3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SarnpQ9D1J3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SarnpQ9D1J3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SarnpQ9D1J3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SarnpQ9D1J3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SarnpQ9D1J3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SarnpQ9D1J3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SarnpQ9D1J3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SarnpQ9D1J3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SarnpQ9D1J3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SarnpQ9D1J3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms