Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D1F3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D1F3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D1F3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D1F3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D1F3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D1F3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9D1F3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9D1F3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D1F3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D1F3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D1F3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms