Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lmbr1lQ9D1E5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms