Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms