Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lsm12Q9D0R8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms