Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P8

Ift27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift27Q9D0P8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift27Q9D0P8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift27Q9D0P8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift27Q9D0P8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift27Q9D0P8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift27Q9D0P8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift27Q9D0P8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift27Q9D0P8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift27Q9D0P8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift27Q9D0P8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift27Q9D0P8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift27Q9D0P8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift27Q9D0P8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift27Q9D0P8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift27Q9D0P8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift27Q9D0P8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift27Q9D0P8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift27Q9D0P8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift27Q9D0P8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift27Q9D0P8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift27Q9D0P8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift27Q9D0P8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift27Q9D0P8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift27Q9D0P8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift27Q9D0P8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift27Q9D0P8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift27Q9D0P8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms