Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ44

Nsfl1c, NSFL1 cofactor p47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsfl1cQ9CZ44 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nsfl1cQ9CZ44 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nsfl1cQ9CZ44 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms