Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Exo5Q9CXP9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Exo5Q9CXP9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Exo5Q9CXP9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Exo5Q9CXP9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Exo5Q9CXP9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Exo5Q9CXP9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Exo5Q9CXP9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Exo5Q9CXP9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Exo5Q9CXP9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Exo5Q9CXP9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Exo5Q9CXP9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Exo5Q9CXP9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Exo5Q9CXP9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Exo5Q9CXP9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Exo5Q9CXP9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Exo5Q9CXP9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Exo5Q9CXP9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Exo5Q9CXP9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Exo5Q9CXP9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Exo5Q9CXP9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Exo5Q9CXP9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Exo5Q9CXP9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Exo5Q9CXP9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Exo5Q9CXP9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Exo5Q9CXP9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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