Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nip7Q9CXK8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nip7Q9CXK8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms