Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgo1Q9CXH7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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