Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed5Q9CXE7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms