Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RpainQ9CWY9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RpainQ9CWY9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms