Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Rpusd4Q9CWX4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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Rpusd4Q9CWX4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Rpusd4Q9CWX4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Rpusd4Q9CWX4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Rpusd4Q9CWX4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Rpusd4Q9CWX4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Rpusd4Q9CWX4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Rpusd4Q9CWX4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Rpusd4Q9CWX4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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Rpusd4Q9CWX4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpusd4Q9CWX4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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