Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pin4Q9CWW6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms