Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Malsu1Q9CWV0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Malsu1Q9CWV0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Malsu1Q9CWV0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Malsu1Q9CWV0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Malsu1Q9CWV0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Malsu1Q9CWV0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Malsu1Q9CWV0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Malsu1Q9CWV0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Malsu1Q9CWV0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Malsu1Q9CWV0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Malsu1Q9CWV0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Malsu1Q9CWV0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Malsu1Q9CWV0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Malsu1Q9CWV0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Malsu1Q9CWV0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Malsu1Q9CWV0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Malsu1Q9CWV0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Malsu1Q9CWV0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Malsu1Q9CWV0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Malsu1Q9CWV0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Malsu1Q9CWV0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Malsu1Q9CWV0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Malsu1Q9CWV0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Malsu1Q9CWV0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Malsu1Q9CWV0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Malsu1Q9CWV0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Malsu1Q9CWV0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Malsu1Q9CWV0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Malsu1Q9CWV0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Malsu1Q9CWV0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Malsu1Q9CWV0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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