Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atxn3Q9CVD2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn3Q9CVD2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms