Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms