Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms