Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Snw1Q9CSN1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snw1Q9CSN1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms