Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms