Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms