Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PclafQ9CQX4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PclafQ9CQX4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PclafQ9CQX4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PclafQ9CQX4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PclafQ9CQX4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PclafQ9CQX4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PclafQ9CQX4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PclafQ9CQX4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PclafQ9CQX4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PclafQ9CQX4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PclafQ9CQX4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms