Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc2Q9CQP2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms