Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Nicn1Q9CQM0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nicn1Q9CQM0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms