Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl35Q9CQL6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl35Q9CQL6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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