Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rwdd1Q9CQK7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rwdd1Q9CQK7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms