Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI9

Med30, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med30Q9CQI9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med30Q9CQI9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med30Q9CQI9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med30Q9CQI9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med30Q9CQI9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med30Q9CQI9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med30Q9CQI9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med30Q9CQI9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med30Q9CQI9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med30Q9CQI9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med30Q9CQI9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med30Q9CQI9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med30Q9CQI9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med30Q9CQI9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med30Q9CQI9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Med30Q9CQI9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Med30Q9CQI9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Med30Q9CQI9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Med30Q9CQI9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Med30Q9CQI9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med30Q9CQI9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms